Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica

Date:
09/12/2015 09:00 - 18/11/2015 14:00
Institution:
Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR)
Venue:
Facultat de Medicina (Pavelló Docent) de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron
Type of Event:
Course
Language:
Catalan
Website:
Web del curs

Description / Information

Dates, places, horaris i lloc de realització

El curs té una durada de 20 hores.
Consisteix en 4 sessions de cinc hores.
Hi haurà 20 places.
Les sessions es faran el dies 9, 11, 16 i 18 de novembre de 2015, de 9 a 14h a l'aula d'informàtica del Mòdul Sud de la Facultat de Medicina (Pavelló Docent) de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron.

Temari del curs

  1. Introducció a la Bioinformàtica
    • Els problemes que tracta la bioinformàtica
    • Aplicació de la bioinformàtica en biomedicina
  2. Bases de dades en biologia molecular
  3. Consulta en bases de dades: Cercadors i navegadors genòmics
  4. Cerca en bases de dades: BLAST i eines relacionades
  5. De la seqüenciació Sanger al Next Generation Sequencing
  6. Aplicacions de l'ultraseqüenciació en biologia i biomedicina
  7. Pre-processat de seqüències i control de qualitat
  8. Anàlisi de variants en exomes
  9. Microarrays
  10. Eines d'anàlisi de significació biològica
  11. RNA-seq
  12. Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
  13. Introducció a les tecnologies de seqüenciació i ultraseqüenciació (NGS)
  14. Aplicacions (I): Tractament de seqüències i cerca de variants
  15. Aplicacions (II): Anàlisi de dades d'expressió
  16. Aplicacions (III): Anotació funcional

Target group

Els curs s'adreça a investigadors -pre o post docs- i professionals de la biomedicina que desitgin aplicar la bioinformàtica en els seus estudis o que, simplement, vulguin entendre millor els estudis realitzats pels bioinformàtics que els donen suport.

Faculty

El curs està organitzat per la Unitat d'Estadística i Bioinformàtica (UEB) i la Unitat d'Alta
Tecnologia (UAT) del Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR).
El curs serà impartit pel cap de la UEB, el Dr. Álex Sánchez, professor titular del departament d'Estadística de la Universitat de Barcelona, i per membres de la UEB/UAT, el Sr. Ferran Briansó, llicenciat en Biologia i màster en Bioinformàtica, el Dr. Xavier de Pedro, Dr. en Biologia i PG en Bioinformàtica, i el Dr. Ricardo Gonzalo, Dr. en Biologia molecular i PG en Bioestadística.

Requirements

Organització

El curs es farà en un aula d'ordinadors de forma que no cal que els alumnes portin ordinadors. La metodologia serà de caire teòrico-pràctic. Cada sessió es dividirà en dues o tres parts, combinant una exposició teòrica i una part pràctica on els alumnes treballaran en grups d'1-2. Es potenciarà el treball amb dades reals i la discussió d'alguns casos que puguin presentar els mateixos alumnes del curs.

Quotes d'inscripció

L'import dels cursos varia segons si s'és membre del VH, de l'esfera UAB o extern a aquestes.
Els preus són els següents:

  • Membres de Vall Hebron (VHIR*/VHIO/HUVH) 130€*
  • Membres d'Esfera UAB o membres de l'Associació BIB 250€
  • Altres 500€

* Personal del VHIR que s'inscrigui abans del dia 2 de novembre podrà gaudir d'un descompte en el preu, que dependrà del nombre de casos, i l'import del qual serà retornat a posteriori.

Contact

Per qualsevol dubte podeu contactar per mail amb Ferran Briansó (ferran.brianso(ELIMINAR)@vhir.org) o per telèfon al 934894007.